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黑料网生物机能开発利用研究センターの黒谷 賢一 特任准教授と野田口 理孝 特任教授（兼 京都大学大学院理学研究科 教授）らの研究グループは、情報?システム研究機構 国立遺伝学研究所大量遺伝情報研究室の中村 保一 教授、公益財団法人かずさDNA研究所植物ゲノム?遺伝学研究室の磯部 祥子 特別客員研究員（現?東京大学 教授）と共同で、生物间相互作用のモデル植物であるベンサミアナタバコ（Nicotiana benthamiana ）の网罗的遗伝子発现プロファイルデータベースを构筑しました。
ベンサミアナタバコは、以前より植物ウイルス等の病害応答の研究に広く使われているにもかかわらず、长らくそのゲノム配列の全貌は明らかになっていませんでしたが、全ゲノム配列の解読を同研究グループが2023年に报告しています（※2023年の报告鲍搁尝参照）。
全ゲノム配列を明らかにしたため、ゲノムにコードされた全遗伝子の発现プロファイルを正确に调べることが可能となりました。
本研究では、ベンサミアナタバコの様々な生育ステージ、植物の部位ごとに网罗的な遗伝子発现状态を次世代シークエンサーを用いて调べ、遗伝子ごとの発现プロファイルをグラフィカルに閲覧可能な遗伝子発现ブラウザ（别贵笔ブラウザ）を构筑しました。また、遗伝子の系统解析や、発现プロファイルに基づくクラスター解析などの遗伝子データ解析プラットフォームを提供することで、ベンサミアナタバコを用いた遗伝子研究を加速し、植物科学の今后の発展がますます期待されます。
本研究成果は、ベンサミアナゲノム解析の国際コンソーシアムとも協力し、2024年12月3日付、国際学術雑誌「The Plant Journal」に掲載されました。

【ポイント】

?重要な実験植物であるベンサミアナタバコの网罗的な遗伝子発现データベースを构筑した。
?遗伝子発现ブラウザ、データ解析ツールを含むデータベースサイトを公开した。

　
◆详细（プレスリリース本文）はこちら

※2023年の报告：
?2023年2月10日付
「ベンサミアナタバコの全ゲノム配列を解析」
/researchinfo/result/2023/02/post-454.html

【论文情报】

雑誌名：the Plant Journal
論文タイトル：Establishing a comprehensive web-based analysis platform for Nicotiana benthamiana genome and transcriptome
（ゲノムとトランスクリプトームのデータベースと遗伝子解析プラットフォームの构筑）
著者：Ken-ichi Kurotani^†, Hideki Hirakawa, Kenta Shirasawa, Koya Tagiri, Moe Mori, Abedelaziz Ramadan, Yasunori Ichihashi, Takamasa Suzuki, Yasuhiro Tanizawa, Jiyuan An, Christopher Winefield, Peter M. Waterhouse, Kenji Miura, Yasukazu Nakamura, Sachiko Isobe, Michitaka Notaguchi^†
（黒谷贤一^†、平川英樹、白澤健太、田桐昂也、森萌恵、Abedelaziz Ramadan、市橋泰範、鈴木孝征、谷澤靖洋、Jiyuan An、Christopher Winefield、Peter M. Waterhouse、三浦謙治、中村保一、磯部祥子、野田口理孝^†）^†共同责任着者
DOI: doi.org/10.1111/tpj.17178
URL:

【研究代表者】

, 主著者：

【関连情报】

　～Researchers' VOICE～No.22 野田口 理孝 准教授に一問一答！